Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Glis3Q6XP49 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Glis3Q6XP49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms