Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl3Q6W5C0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcl3Q6W5C0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms