Protein–RNA interactions for Protein: Q6VYH9

Hsh2d, Hematopoietic SH2 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsh2dQ6VYH9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hsh2dQ6VYH9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hsh2dQ6VYH9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms