Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms