Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdk2Q6V4S5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdk2Q6V4S5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms