Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GcsamQ6RFH4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GcsamQ6RFH4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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