Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc57Q6PHN1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc57Q6PHN1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms