Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trim45Q6PFY8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim45Q6PFY8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms