Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad54bQ6PFE3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms