Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SvoplQ6PDF3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SvoplQ6PDF3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms