Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Gapvd1Q6PAR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gapvd1Q6PAR5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms