Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr2mQ6P6I6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Polr2mQ6P6I6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms