Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smchd1Q6P5D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smchd1Q6P5D8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms