Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg2aQ6P4T0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms