Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slx4Q6P1D7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slx4Q6P1D7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Slx4Q6P1D7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms