Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig3Q6P1C6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms