Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Soga3Q6NZL0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Soga3Q6NZL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Soga3Q6NZL0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Soga3Q6NZL0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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