Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad17Q6NXW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms