Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gpbp1Q6NXH3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpbp1Q6NXH3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms