Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.01■■□□□ 1.6
SphkapQ6NSW3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SphkapQ6NSW3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SphkapQ6NSW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms