Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcd11Q6NS46 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms