Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep78Q6IRU7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cep78Q6IRU7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms