Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ParpbpQ6IRT3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ParpbpQ6IRT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms