Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Arhgap20Q6IFT4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arhgap20Q6IFT4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms