Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Otud6aQ6IE21 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud6aQ6IE21 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms