Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11bQ6DFW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp11bQ6DFW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms