Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170Q6A065 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170Q6A065 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170Q6A065 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms