Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pkp4Q68FH0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pkp4Q68FH0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms