Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sbno1Q689Z5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sbno1Q689Z5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms