Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Clcn1Q64347 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn1Q64347 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Clcn1Q64347 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn1Q64347 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Clcn1Q64347 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms