Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Irf4Q64287 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Irf4Q64287 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms