Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pan3Q640Q5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pan3Q640Q5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms