Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Znf260Q62513 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf260Q62513 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf260Q62513 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Znf260Q62513 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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