Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Itga3Q62470 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itga3Q62470 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms