Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vat1Q62465 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms