Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nptx1Q62443 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nptx1Q62443 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms