Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha6Q62413 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms