Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf6Q62311 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf6Q62311 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms