Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SypQ62277 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SypQ62277 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SypQ62277 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SypQ62277 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SypQ62277 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SypQ62277 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SypQ62277 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SypQ62277 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SypQ62277 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms