Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ttf1Q62187 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttf1Q62187 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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