Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RhocQ62159 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RhocQ62159 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms