Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sin3bQ62141 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms