Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PtprrQ62132 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprrQ62132 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms