Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Npm1Q61937 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms