Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hes3Q61657 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hes3Q61657 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms