Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Erbb3Q61526 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Erbb3Q61526 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms