Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dsg1aQ61495 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms