Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccne1Q61457 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccne1Q61457 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms