Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf9Q61179 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf9Q61179 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf9Q61179 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf9Q61179 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms