Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf1Q61069 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms